L'òrgan de govern i representació de la Confederació d’AMPA Gonzalo Anaya dirigeix i executa les decisions de l'Assemblea General. Actualment els membres de la Junta Directiva són:
CÀRRECS NOM FEDERACIÓ
President Rubén Pacheco Díaz FAMPA-València
Vicepresidenta 1ª Helena Martinavarro Molla FAMPA Castelló Penyagolosa
Vicepresident 2ª Núria López López FAMPA Enric Valor Alacant
Secretaria d’Organització Juan Manuel Segura Garcia FAMPA Enric Valor Alacant
Secretària de Finances Josep Pasqual Albiol Esteller FAMPA Castelló Penyagolosa
Secretari d'Administració Cristina Galiana Zafra FAMPA-València
Vocal 1 Javier Pérez Altozano FAMPA Enric Valor Alacant
Vocal 2 Solange V. Godoy FAMPA-València
Vocal 3 Michel Toumi Borges FAMPA Castelló Penyagolosa
Suplent 1 Adrian Arribas Ávila FAMPA Castelló Penyagolosa
Suplent 2 Vicent Gumbau Ferrandis FAMPA Castelló Penyagolosa
Suplent 3 Santiago Martínez Carbonell FAMPA-València
Suplent 4 José Manuel Casermeiro Castro FAMPA-València
Suplent 5 Antonio Verdú Carrasco FAMPA Enric Valor Alacant