La Confederación de Asociaciones de Padres y Madres de alumnos de la Comunidad Valenciana "Gonzalo Anaya" se fundó el 10 de marzo de l´any 2001, con el objectiu de defender una enseñanza pública de calidad. Desde entonces está formada por tres federaciones provinciales, FAPA-València, FAPA Penyagolosa de Castellón y FAPA Enric Valor de Alicante, y, por eso, tiene como a principal actividad lograr la unidad de acción, desde la coordinación de las federaciones de APA/AMPA que la integran.
La Confederación Gonzalo Anaya es una organización sin ánimo de lucro, que se declara aconfesional, con total independencia política, administrativa, sindical y de cualquier otro sector. Por ser la organización mayoritaria de los padres y madres de alumnos de la escuela pública, la Confederación está representada en el Consejo Escolar Valenciano, en la Mesa de Padres y Madres y en la Confederación Española de Asociaciones de Padres de Alumnos (CEAPA).
El órgano de gobierno y de representación de la Confederación Gonzalo Anaya es la Junta Directiva que lleva a cabo la dirección y la ejecución de las decisiones emanadas de la Asamblea General de acuerdo con la propia normativa. La elección de la Junta Directiva de la Confederación se realiza mediando turno rotativo y tiene una vigencia de dos años.
Por ello el pasado 30 de junio de 2007 se celebró la Asamblea General para conformar, como marca los estatutos, una nueva Junta Directiva.

La Junta Directiva está formada per Rosa Giménez, presidenta, Gemma Piqué, Vicepresidenta Primera, José Tomás Lillo, Vicepresidente Segundo, Torcuato Saavedra, Secretario de Organización, Isabel Mª Vicent Soriano, Secretaria de Administración, Alfredo Mont, Secretario de Finanzas y Adoración Martínez, Encarnación Salvador i Vicent Dosdà, Vocales.