La Confederación de Asociaciones de Padres y Madres de alumnos de la Comunidad Valenciana "Gonzalo Anaya" se fundó el 10 de marzo de l´any 2001, con el objectiu de defender una enseñanza pública de calidad. Desde entonces está formada por tres federaciones provinciales, FAPA-València, FAPA Penyagolosa de Castellón y FAPA Enric Valor de Alicante, y, por eso, tiene como a principal actividad lograr la unidad de acción, desde la coordinación de las federaciones de APA/AMPA que la integran.

La Confederación Gonzalo Anaya es una organización sin ánimo de lucro, que se declara aconfesional, con total independencia política, administrativa, sindical y de cualquier otro sector. Por ser la organización mayoritaria de los padres y madres de alumnos de la escuela pública, la Confederación está representada en el Consejo Escolar Valenciano, en la Mesa de Padres y Madres, órganos de consulta de la Conselleria de Educación. 

El órgano de gobierno y de representación de la Confederación Gonzalo Anaya es la Junta Directiva que lleva a cabo la dirección y la ejecución de las decisiones emanadas de la Asamblea General de acuerdo con la propia normativa. La elección de la Junta Directiva de la Confederación se realiza mediando turno rotativo y tiene una vigencia de dos años.